L'action se déroule dans le village fictif d'Hanuda, isolé au cœur des montagnes dans le comté de Misumi au Japon. Le 29 juillet 2003, peu avant minuit, la communauté religieuse locale se regroupe dans le clair de lune pour accomplir un rite sacrificiel. La cérémonie tourne au fiasco. À minuit, une sirène retentit dans la vallée, la terre tremble et une mer rouge sang engloutit les terres autour du village qui s'évanouit dans un espace-temps coupé du monde réel. Inexorablement attirés par le son de la sirène, les villageois s'engouffrent dans l'eau rouge pour en ressortir sous la forme de Shibitos, des morts-vivants. Ils s'affairent à une étrange construction tout en massacrant les rares humains non corrompus. Durant trois jours, dix personnes tentent de survivre au milieu de l'horreur, livrant peu à peu leur vérité.